没有领证但是已经做了婚前检查并且存档，现在要分开应该怎么办？

没有领证就是没有法律上登记就不受保护，你们就不是夫妻啊，直接分开就好了，没有什么影响。

你既然还没有领证，那么在法律上你们俩还不属于夫妻，这个时候如果觉得不合适。就好聚好散就好了，不要勉强结婚，做了婚前检查也没关系。