行政诉讼，离婚登记程序存在瑕疵为由.可否

可以提起行政诉讼。
自2011年8月13起施行的《最高人民法院关于适用< 人民共和国婚姻法>若干问题的解释（三）》(法释〔2011〕18号)第一条第二款中明确规定“当事人以结婚登记程序存在瑕疵为由提起民事诉讼，主张撤销结婚登记的，告知其可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。”

可以的